Yüksek lisans yaptığı süreçte beraber kazılarda çalıştığı İstanbul Üniversitesi Prehistorya Anabilimdalı’nda Prof. Dr. Necmi Karul tarafından sistematik tacize uğradığını söyleyen Canan Alpagut, yaşadıklarını 5 sayfalık bir mektupla kamuoyu ile paylaştı. T24’te yer alan haber göre, Alpagut, taciz ifşasının yer aldığı mektubunda, şu ifadelere yer verdi:

''Birçok tacize uğrayan kadın gibi ben de ilk başlarda ‘hayır ben yanlış anlıyorumdur, bu düşündüğüm olamaz; kaç yıldır yanında çalıştığım, yanında yetiştiğim ve “hocam” dediğim insan bana bunu yapmaz’ dedim. Bir süre geçtikten sonra anladım ki aslında hiç de çekinmeden, utanmadan yapabiliyormuş. İstanbul’da o kadar rahatsız edici olmamasına rağmen (kadın olarak buna bile razı bırakılıyor insan), kazıda bulunduğumuz süre zarfında tavırlarının çok rahatsız edici boyutlara vardığı zamanlar oldu. Çok uzun süre buna ben mi sebebiyet verdim, ben de “rızam varmış” gibi mi davrandım, ben kapıyı ona araladım o da girmeye mi çalışıyor diye kendimi suçladım durdum.”

Süreci anlatan Alpagut, Kurul’dan kaçtığını anlattığı mektubunda şunları ifade etti:

“Ama gerçeklerden daha fazla kaçamayacağım ve inkar edemeyeceğim zaman geldiğinde, bunun apaçık bir cinsel taciz olduğu sonucuyla yüz yüzeydim. Ben abartmıyordum, o taciz ediyordu!''

İstanbul Üniversitesi Tarih Öncesi Arkeolojisi (Prehistorya) Anabilim Dalı mensupları, ''Konu ile ilgili idari ve hukuki süreç başlamıştır. İtham edilen kişi kendisi ve Anabilim Dalı mensuplarının isteği ile halen yürütmekte olduğu Anabilim Dalı Başkanlığı görevini süreç sonuçlanıncaya kadar bırakmıştır'' şeklinde bir açıklama yaparak Necmi Karul’un görevden ayrıldığını duyurdu.