Saray rejiminin şefi Erdoğan’ın kararı ile Boğaziçi Üniversitesi Rektörlüğü’ne Naci İnci atandı. Özerk demokratik üniversite talebiyle aylar süren direniş sonrasında AKPli rektör Melih Bulu görevden alınmış ve yerine vekaleten Naci İnci getirilmişti.
İnci, vekaleten göreve gelir gelmez Boğaziçi Üniversitesi akademisyenlerinden Can Candan’ın işine son verdi. Naci İnci Boğaziçi Üniversitesi’nde eylemler sürerken Melih Bulu’nun yardımcısı olarak atanmış ve eylemdeki öğrencilerin yanına gelmişti. Öğrenciler ise İnci’ye tepki göstererek şunları ifade etmişti:
"Bu kadar meslektaşınız, öğrenciniz protesto ederken, nasıl kabul ettiniz, tutuklu öğrencileriniz varken, onlarca kişi gözaltına alınmışken, 51 öğrenciniz süreklenerek gözaltına alınırken, hiç utanmanız yok mu?"
Boğaziçi Üniversitesi’nin yanı sıra YÖK Başkanı olarak atanan Prof. Dr. Erol Özvar'ın yerine Marmara Üniversitesi Rektörülüğü’ne Prof. Dr. Mustafa Kurt atandı.